应急战“痘”记

来源: 发布时间:2022-10-11

  2022年9月14日晚,中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所应急技术中心收到重要信息:“重庆发现一例疑似输入猴痘病例”。随后,谭文杰主任立即对实验室检测涉及的各个环节及相关责任人进行了梳理。当晚,就BSL-3实验室的使用进行了详细沟通,并迅速与重庆疾病预防控制中心进行对接,就标本采集、储存、运送各个环节进行了深入、细致的交流,确保送检样本满足实验室检测要求。与此同时实验室管理办公室紧急办理了样本转运所需手续。

  次日上午9时,应急技术中心召开紧急会议,就猴痘病毒实验室检测工作进行周密部署。2022年9月15日晚10:00,实验室管理办公室人员机场接样。2022年9月16日凌晨2点,重庆送检样本到达病毒病所。工作人员首先在BSL-3实验室清点、核对标本信息,并完成核酸提取的前处理工作、病毒分离;随后迅速开始核酸提取和qPCR检测、测序工作。凌晨5点多,核酸检测结果提示重庆送检疑似猴痘病例标本全部为猴痘病毒核酸阳性,至此确认了中国大陆首例输入性猴痘病例。猴痘病毒分型qPCR检测结果提示本次检测标本含有猴痘病毒西非支基因序列。稍后,电镜检测原始样本内可见极少量形态典型的痘病毒颗粒。接着测序组获得了第一条猴痘病毒基因组有效测序数据,经实时分析发现,送检标本中携带的病毒基因组序列与猴痘病毒参考基因组(MPXV-UK_P3)相似性超过99%,进一步确定了重庆市送检疑似猴痘病例标本含猴痘病毒。利用Nextclade猴痘病毒分子分型系统进行序列比对,证明本次报送样本中携带猴痘病毒属于西非株系(B.1进化分支)。经与GISAID数据库中的猴痘基因组序列相比,重庆疑似猴痘感染病例标本中病毒基因组序列与德国2022年6月21日所采集样本中的猴痘病毒基因组序列(GISAID ID:EPI_ISL_13889435)最为相似。2022年9月18日上午,重庆送检标本感染细胞出现明显细胞病变,显微镜下可见明显的噬斑,经电镜检测,镜下可见清晰的痘病毒颗粒。至此,重庆送检疑似猴痘病例标本检测工作初战告捷。随后,应急技术中心将开展单斑纯化、病毒分离鉴定等一系列实验,为我国猴痘病毒的病原学、疫苗学等相关工作的开展提供实验数据和宝贵的病毒资源。

  本次应急战“痘”响应中,病毒病所应急技术中心与所内多部门、多科室通力合作,从接收样本到完成核酸检测用时不到4个小时,完成全基因组(近200kb)序列分析用时不到12小时,继新冠疫情后,我所多部门协同作战应对突发疫情,再次发挥一锤定音、即战即捷的作用。同时特别感谢中国疾病预防控制中心应急办、重庆疾控中心等单位的大力支持!

王文玲、吴长城撰稿,谭文杰审校(应急技术中心)供稿