病原生物学——宋敬东

　　一、个人简介

　　宋敬东，男，医学博士，研究员，就职于洪涛院士实验室。2004年毕业于泰山医学院，获临床医学专业医学学士学位；2007年毕业于山东省医学科学院，获病原生物学专业医学硕士学位；2012年毕业于中国疾病预防控制中心，获免疫学专业医学博士学位。2014年9月-10月，于美国疾控中心传染病病理实验室进修。2007年7月至2020年6月，历任研究实习员、助理研究员、副研究员，2020年7月至今任研究员。

　　至今先后主持或参与国家自然科学基金项目、国家艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治专项、国家重点研发计划、传染病预防控制国家重点实验室自主研究课题面上项目、中国疾病预防控制中心青年科研基金等12项。至今发表论文130余篇，其中以第一作者、通讯作者在Nature communications、Protein Cell、PNAS、EID、JMB、PLOS biology、Briefings in Bioinformatics、《病毒学报》等著名杂志发表论文30余篇，出版专著1部，参编专著5部，获得国家授权专利3项（第一发明人）。

　　2020年初在全球率先完成新冠病毒形态鉴定。并曾参加EV71、SFTSV、H7N9流感病毒、H7N4流感病毒、寨卡病毒、黄热病毒、裂谷热病毒、猴痘病毒等重大疫情病原体鉴定工作，作为骨干和负责人两次赴非洲参与埃博拉疫情防控工作。

　　2017年获得国家卫计委“优秀共产党员”称号、2018年入选中国疾控中心“优才计划”核心人才，2022年获首届全国卫生健康行业青年创新大赛金奖，2022 年获北京市科学技术进步奖一等奖（排名第十）。

　　曾任中国医学影像技术研究会电子显微学分会主任委员，中国医学影像学会常务理事、中国电子显微镜学会委员、中国研究型医院学会超微与分子病理学专业委员会委员、中国微生物学会分析微生物专业委员会委员、北京理化分析测试技术学会电子显微学专业委员会理事、《中华实验和临床病毒学杂志》编委。

　　二、主要研究方向

　　1、病毒形态发生学研究

　　2、病毒结构生物学研究

　　3、病毒感染机制研究

　　三、代表性论文、成果

　　1．洪涛、王健伟、宋敬东. 医学病毒图谱，科学出版社，2016

　　2．Xiao H, Tan L, Tan Z, Zhang Y, Chen W, Li X, Song J, Cheng L, Liu H,Song J*, Cheng L*, Liu H*,Structure of the siphophage neck–Tail complex suggests that conserved tail tip proteins facilitate receptor binding and tail assembly,PLOS biology, 2023, 21(12):e3002441.(*corresponding author)

　　3．Xiao C, Wang J, Yang S, Heng M, Su J, Xiao H, Song J*, Li W*. VISN: virus instance segmentation network for TEM images using deep attention transformer. Brief Bioinform. 2023, 22;24(6):bbad373.(*corresponding author)

　　4．Chi Xiao, Xiaoyu Xia, Shunhao Xu, Qilin Huang, Hao Xiao, Jingdong Song*. Automatic SARS-CoV-2 Segmentation in Electron Microscopy Based on Few-shot Learning. International Journal of Wavelets, Multiresolution and Information Processing.2023.22. 10.1142/S0219691323500479.(*corresponding author)

　　5．Wenyuan Chen, Hao Xiao, Li Wang, Xurong Wang, ZAutomatic SARS-CoV-2 Segmentation in Electron Microscopy Based on Few-shot Learning. International Journal of Wavelets, Multiresolution and Information Processing.hixue Tan, Zhen Han, Xiaowu Li, Fan Yang, Zhonghua Liu, Jingdong Song*, Hongrong Liu*, Lingpeng Cheng*. Structural changes in bacteriophage T7 upon receptor-induced genome ejection. PNAS. 2021, 118(37):e2102003118. (*corresponding author)

　　6．Wenyuan Chen, Hao Xiao, Xurong Wang, Shuanglin Song, Zhen Han, Xiaowu Li, Fan Yang, Li Wang, Jingdong Song*, Hongrong Liu*,Lingpeng Cheng*. Structural changes of a bacteriophage upon DNA packaging and maturation. Protein Cell, 2020,11(5):374-379. (*corresponding author)

　　7．Xiaowu Li, Li Wang, Xurong Wang, Wenyuan Chen, Tao Yang, Jingdong Song*, Hongrong Liu*, Lingpeng Cheng*. Structure of RdRps within a transcribing dsRNA virus provides insights into the mechanisms of RNA synthesis. Journal of Molecular Biology,2020, 432(2):358-366 (*corresponding author)

　　8．Na Zhu, Wenling Wang, Zhidong Liu, Chaoyang Liang, Wen Wang, Fei Ye, Baoying Huang, Li Zhao, Huijuan Wang, Weimin Zhou, Yao Deng, Longfei Mao, ChongyuSu, Guangliang Qiang, Taijiao Jiang, Jincun Zhao, Guizhen Wu, Jingdong Song*, Wenjie Tan*. Morphogenesis and cytopathic effect of SARS-CoV-2 infection in human airway epithelial cells. NatureCommunications, 2020,6;11(1):3910 (*corresponding author)

　　9．Liqi Zhou*, Jingdong Song*, Judy S. Kim*, Xudong Pei, Chen Huang, Mark Boyce, Luiza Mendon?a, Daniel Clare, Alistair Siebert, Christopher S. Allen, Emanuela Liberti, David Stuart, Xiaoqing Pan, Peter D. Nellist, Peijun Zhang, Angus I. Kirkland, Peng Wang. Low-dose phase retrieval of biological specimens using cryo-electron ptychography. NatureCommunications,2020,11(1):2773. (*first author)

　　10．Chi Xiao, Xi Chen, Qiwei Xie, Guoqing Li, Hao Xiao, Jingdong Song*, Hua Han*.Virus identification in electron microscopy images by residual mixed attention network. Computer Methods and Programs in Biomedicine, 2020, 198:105766 (*corresponding author)